Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csn1s1P19228 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms