Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms