Protein–RNA interactions for Protein: L7N481

Gm6309, Predicted gene 6309, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6309L7N481 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6309L7N481 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms