Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Taf4bG5E8Z2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Taf4bG5E8Z2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Taf4bG5E8Z2 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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