Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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