Protein–RNA interactions for Protein: Q9D958

Spcs1, Signal peptidase complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spcs1Q9D958 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Spcs1Q9D958 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms