Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms