Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
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Hoxc12Q8K5B8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Hoxc12Q8K5B8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Hoxc12Q8K5B8 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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