Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cfap100Q80VN0 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms