Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
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Dsg1bQ7TSF1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Dsg1bQ7TSF1 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Dsg1bQ7TSF1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Dsg1bQ7TSF1 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Dsg1bQ7TSF1 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Dsg1bQ7TSF1 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Dsg1bQ7TSF1 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Dsg1bQ7TSF1 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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