Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Eci3Q78JN3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms