Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms