Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rnf180Q3U827 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rnf180Q3U827 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rnf180Q3U827 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rnf180Q3U827 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rnf180Q3U827 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rnf180Q3U827 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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