Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snai1Q02085 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms