Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Pde1bQ01065 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Pde1bQ01065 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Pde1bQ01065 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Pde1bQ01065 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Pde1bQ01065 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde1bQ01065 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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