Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms