Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
SeboxP70368 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms