Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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