Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P10404 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P10404 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P10404 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms