Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm3415J3QMS8 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gm3415J3QMS8 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gm3415J3QMS8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gm3415J3QMS8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gm3415J3QMS8 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gm3415J3QMS8 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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