Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G3

Opcml, MCG9827, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OpcmlG5E8G3 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
OpcmlG5E8G3 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms