Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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