Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12□□□□□ -0.49
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Gm6880A3KG45 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm6880A3KG45 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm6880A3KG45 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm6880A3KG45 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm6880A3KG45 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm6880A3KG45 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm6880A3KG45 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm6880A3KG45 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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