Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PapolbQ9WVP6 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PapolbQ9WVP6 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PapolbQ9WVP6 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PapolbQ9WVP6 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PapolbQ9WVP6 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PapolbQ9WVP6 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PapolbQ9WVP6 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PapolbQ9WVP6 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PapolbQ9WVP6 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PapolbQ9WVP6 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PapolbQ9WVP6 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PapolbQ9WVP6 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PapolbQ9WVP6 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PapolbQ9WVP6 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PapolbQ9WVP6 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PapolbQ9WVP6 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PapolbQ9WVP6 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PapolbQ9WVP6 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PapolbQ9WVP6 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PapolbQ9WVP6 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PapolbQ9WVP6 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PapolbQ9WVP6 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PapolbQ9WVP6 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PapolbQ9WVP6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PapolbQ9WVP6 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PapolbQ9WVP6 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PapolbQ9WVP6 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PapolbQ9WVP6 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PapolbQ9WVP6 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PapolbQ9WVP6 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PapolbQ9WVP6 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PapolbQ9WVP6 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PapolbQ9WVP6 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PapolbQ9WVP6 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PapolbQ9WVP6 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PapolbQ9WVP6 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PapolbQ9WVP6 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PapolbQ9WVP6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PapolbQ9WVP6 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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