Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snx20Q9D2Y5 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms