Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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