Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms