Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIM5

Myocd, Myocardin, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyocdQ8VIM5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyocdQ8VIM5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms