Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZX4

Rbm17, Splicing factor 45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm17Q8JZX4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbm17Q8JZX4 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms