Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ9

Phf20l1, PHD finger protein 20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf20l1Q8CCJ9 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf20l1Q8CCJ9 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf20l1Q8CCJ9 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf20l1Q8CCJ9 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf20l1Q8CCJ9 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf20l1Q8CCJ9 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf20l1Q8CCJ9 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf20l1Q8CCJ9 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf20l1Q8CCJ9 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf20l1Q8CCJ9 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf20l1Q8CCJ9 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf20l1Q8CCJ9 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf20l1Q8CCJ9 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf20l1Q8CCJ9 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf20l1Q8CCJ9 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf20l1Q8CCJ9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf20l1Q8CCJ9 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf20l1Q8CCJ9 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf20l1Q8CCJ9 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf20l1Q8CCJ9 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf20l1Q8CCJ9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf20l1Q8CCJ9 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf20l1Q8CCJ9 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf20l1Q8CCJ9 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf20l1Q8CCJ9 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf20l1Q8CCJ9 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms