Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Dsg1bQ7TSF1 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Dsg1bQ7TSF1 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Dsg1bQ7TSF1 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Dsg1bQ7TSF1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Dsg1bQ7TSF1 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Dsg1bQ7TSF1 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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