Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Vma21Q78T54 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Vma21Q78T54 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Vma21Q78T54 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vma21Q78T54 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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