Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Surf4Q64310 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms