Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Mir466f-2-201ENSMUST00000104805 94 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd5Q3V1H9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms