Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samd11Q1RNF8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Samd11Q1RNF8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samd11Q1RNF8 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms