Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms