Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms