Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms