Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Irx1P81068 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irx1P81068 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irx1P81068 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Irx1P81068 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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