Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp3P63024 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms