Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms