Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kif5cP28738 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms