Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pde6aP27664 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Pde6aP27664 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Pde6aP27664 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Pde6aP27664 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Pde6aP27664 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Pde6aP27664 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Pde6aP27664 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Pde6aP27664 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Pde6aP27664 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pde6aP27664 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pde6aP27664 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pde6aP27664 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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