Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NefhP19246 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NefhP19246 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NefhP19246 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NefhP19246 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NefhP19246 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NefhP19246 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NefhP19246 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NefhP19246 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NefhP19246 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NefhP19246 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NefhP19246 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NefhP19246 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NefhP19246 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NefhP19246 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NefhP19246 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NefhP19246 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NefhP19246 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NefhP19246 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NefhP19246 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NefhP19246 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NefhP19246 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NefhP19246 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NefhP19246 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NefhP19246 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NefhP19246 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NefhP19246 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NefhP19246 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NefhP19246 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NefhP19246 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NefhP19246 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NefhP19246 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NefhP19246 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NefhP19246 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NefhP19246 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NefhP19246 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NefhP19246 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NefhP19246 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NefhP19246 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NefhP19246 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NefhP19246 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NefhP19246 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NefhP19246 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NefhP19246 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NefhP19246 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NefhP19246 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NefhP19246 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NefhP19246 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NefhP19246 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NefhP19246 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NefhP19246 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NefhP19246 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NefhP19246 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NefhP19246 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NefhP19246 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NefhP19246 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NefhP19246 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NefhP19246 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NefhP19246 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NefhP19246 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NefhP19246 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NefhP19246 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NefhP19246 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NefhP19246 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NefhP19246 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NefhP19246 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NefhP19246 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NefhP19246 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NefhP19246 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NefhP19246 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NefhP19246 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NefhP19246 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NefhP19246 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NefhP19246 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NefhP19246 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NefhP19246 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NefhP19246 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NefhP19246 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NefhP19246 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NefhP19246 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NefhP19246 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NefhP19246 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NefhP19246 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NefhP19246 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NefhP19246 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NefhP19246 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NefhP19246 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NefhP19246 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NefhP19246 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NefhP19246 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NefhP19246 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NefhP19246 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NefhP19246 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NefhP19246 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NefhP19246 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NefhP19246 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NefhP19246 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NefhP19246 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NefhP19246 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NefhP19246 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms