Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18530 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18530 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms