Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04212 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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