Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FxnO35943 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FxnO35943 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FxnO35943 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FxnO35943 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FxnO35943 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FxnO35943 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FxnO35943 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FxnO35943 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FxnO35943 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FxnO35943 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
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FxnO35943 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FxnO35943 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FxnO35943 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FxnO35943 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
FxnO35943 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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FxnO35943 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FxnO35943 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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FxnO35943 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FxnO35943 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FxnO35943 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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FxnO35943 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FxnO35943 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FxnO35943 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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FxnO35943 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FxnO35943 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FxnO35943 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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FxnO35943 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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FxnO35943 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FxnO35943 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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FxnO35943 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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FxnO35943 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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FxnO35943 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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FxnO35943 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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