Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP8

Gm21863, Predicted gene, 21863, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21863J3KMP8 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21863J3KMP8 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms