Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms