Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ChmQ9QXG2 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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